La tropa Gusano se fue a tomar unas vacaciones a la playa para descansar de todas sus guerras, pero Trubby ve algo, un OVNI se acerca y de él salen unos gusanos llamados 'Worms Cyborg' y el capo gordo, Drake Worm Philip II, que quiere conquistar el universo con su ejército cada vez mayor.
La tropa Gusano está de nuevo en problemas, y deberán ir por todos los periodos y países para detener al malvado.